3月9日，芜湖市人民政府印发了《关于开展第一次全市污染源普查的通知》（芜政秘〔2007〕31号），确定成立第一次全市污染源普查领导小组，负责普查的组织和实施工作。洪建平副市长任组长，市政府副秘书长罗本见、市环保局局长徐英馥、市统计局局长潘天武任副组长，市委宣传部、市发展改革委、市经委、市财政、市建委、市农委、市工商、市开发区和四区政府等部门的领导同志任领导小组成员。领导小组办公室设在市环保局，由市环保局副局长舒辅民同志兼任办公室主任。
8月31日，市环保局成立了第一次全市污染源普查领导小组办公室，负责具体普查工作。普查办内设综合协调组、技术调查组、数据处理组、宣传组和农业源调查组。职责主要包括：拟订全市污染源普查实施方案；制定和细化各类普查技术方案；污染源普查数据的汇总、数据录入与数据库的建立、数据分析和普查报告编制；负责普查联络、组织普查宣传培训活动等。